Учреждение имеет в составе следующие структурные подразделения:
- Участковая больница с.Ново-Аул
- Участковая больница с.Тагиркент-Казмаляр
- Врачебная амбулатория с.Советское
- Врачебная амбулатория с.Мугерган
- Врачебная амбулатория с.Капир-казмаляр
- Врачебная амбулатория с.Оружба
- Врачебная амбулатория с.Самур
- Фельдшерско-акушерские пункты,
- ФАП с. Яраг;
- ФАП с. Куйсун;
- ФАП с. Гапцах;
- ФАП с. Гильяр;
- ФАП с. Картас-казмаляр;
- ФАП с. Целегюн;
- ФАП с. Ходжа-казмаляр;
- ФАП с. Бут-казмаляр;
- ФАП с. Филя;
- ФАП с. Кчун-казмаляр;
- ФАП с. Азадоглы;
- ФАП с. Хтун-казмаляр;
- ФАП с. Чах Чах;
- ФАП с. Биль-биль;
- Фельдшерские пункты,
- ФП с. Гарах;
- ФП с. Хорель;
- ФП с. Кирка;
- ФП с. Джепель;
- ФП с. Тагиркент;
- ФП с. Яруквалар;
- ФП с. Кличхан;
- ФП с. Примор;